Barack Obama elnöksége alatt megszaporodtak az olyan katonai akciók, amelyek egyes al-Kaida-tagok megölését célozták. A New York Times szerint a célpontok listájáról személyesen maga az elnök dönt. A cikk szerint Obama átolvassa mindegyik személy életrajzát, és ez után dönt arról, hogy rákerülhet-e a listára.
A támadások egy jelentős részét úgynevezett drónokkal, távirányítású roportrepülőkkel hajtják végre. Csak április óta 14 ilyen akció volt Jemenben és 6 Pakisztánban. Ezek a támadások gyakran járnak civil áldozatokkal is, ami miatt a terrorszervezetek ezekre hivatkozva próbálnak minél több új tagot toborozni maguk közé.
Obamát gyakran bírálják jogvédők a szerintük átláthatlatlan módon előkészített és jogilag nem feltétlenül megalapozott akciók miatt. Különösen nagy vitát váltott ki az, amikor egy amerikai állampolgárságú al-Kaida-taggal végzett az egyik akció.