J. Lee Thompson olyan alkotásokkal bizonyította tehetségét, mint A majmok bolygója és a Cape Fearvagy a Navarone fegyverei, de sokat dolgozott együtt Charles Bronsonnal, Gregory Peckkel és Anthony Quinn-nel is.
Thompson filmes pályáját a londoni Elstree Studiosnál kezdte szerkesztő-asszisztensként, azután Alfred Hichcock két filmjében is segédkezett. Legelső filmjét, a Bűntény nélküli gyilkosság-ot 1950-ben rendezte. Thompson, miután megkapta 1961-ben a Navarone ágyúi-ért az Academy Award-ot, átköltözött az Egyesült Államokba, ahol több amerikai tárgyú munkája is született, így például a Huckleberry Finn című musical 1974-ben. Itt rendezte 1972-ben a nagysikerű Majmok bolygója 4. részét, majd a következő évben, 1973-ban az 5. részt. Több filmjével is nyert európai filmszemléken. A híres rendező 40 éves feleségét, Pennyt, egy leánygyermeket és egy leányunokát hagyott maga után - fia, Peter Lee ugyanis már korábban meghalt.