A 2006-os németországi labdarúgó-világbajnokság selejtezőjének a végéig Ilja Petkovic marad a szerb-montenegrói válogatott szövetségi kapitánya.
A szakembert július 10-én nevezték ki, miután az Eb-kvalifikációs rossz eredmények következtében Dejan Savicevic június 11-én lemondott. A tréner azért állt fel, mert csapata négy nap alatt Finnországtól, majd Azerbajdzsántól szenvedett vereséget, s ezzel szinte reménytelen helyzetbe került a továbbjutást illetően.
Végül az együttes harmadik lett Olaszország és Wales mögött, Petkovic vezetésével hazai pályán az Eb-ezüstérmes Trapattoni-csapattal döntetlent játszott, az utolsó fordulóban pedig idegenben legyőzte a pótselejtezőt játszó szigetországiakat.
A most 57 éves edző 2001-ben már két hónapig vezette a válogatott szakmai munkáját, de a Luxemburg elleni 2-0-s győzelem után egy kínai ajánlat miatt lemondott.